Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdk18Q04899 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdk18Q04899 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms