Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms