Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcad1Q04692 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms