Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nucb1Q02819 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms