Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a2Q02788 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a2Q02788 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms