Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms