Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GscQ02591 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GscQ02591 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GscQ02591 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GscQ02591 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GscQ02591 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms