Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcqQ02111 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms