Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
VcpQ01853 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VcpQ01853 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms