Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mc1rQ01727 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms