Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Top2aQ01320 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Top2aQ01320 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms