Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EgfrQ01279 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms