Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HmgcrQ01237 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms