Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb2Q00977 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms