Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbp10Q000W5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms