Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gfra1P97785 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gfra1P97785 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms