Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gata5P97489 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms