Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms