Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bop1P97452 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms