Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smyd1P97443 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smyd1P97443 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms