Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SmsP97355 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SmsP97355 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SmsP97355 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SmsP97355 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SmsP97355 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SmsP97355 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SmsP97355 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms