Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pkp1P97350 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkp1P97350 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms