Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SgcgP82348 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SgcgP82348 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms