Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SgcdP82347 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgcdP82347 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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