Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx1P80205 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Otx1P80205 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms