Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UrodP70697 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UrodP70697 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UrodP70697 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UrodP70697 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms