Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcr4P70658 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms