Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Tp53bp1P70399 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tp53bp1P70399 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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