Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1P70338 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms