Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pitx1P70314 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pitx1P70314 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms