Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sycp3P70281 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sycp3P70281 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms