Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms