Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NficP70255 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NficP70255 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NficP70255 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NficP70255 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms