Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf5P70191 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms