Protein–RNA interactions for Protein: P63239

Pcsk1, Neuroendocrine convertase 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1P63239 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1P63239 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk1P63239 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pcsk1P63239 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk1P63239 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Pcsk1P63239 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Pcsk1P63239 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms