Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Kcnab1P63143 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnab1P63143 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Kcnab1P63143 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Kcnab1P63143 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Kcnab1P63143 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Kcnab1P63143 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms