Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Depdc5P61460 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Depdc5P61460 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc5P61460 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc5P61460 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc5P61460 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Depdc5P61460 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms