Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr2fP61219 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr2fP61219 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms