Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Snap25P60879 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snap25P60879 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms