Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ActbP60710 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ActbP60710 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms