Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scarf2P59222 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scarf2P59222 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms