Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrnp3P59055 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrnp3P59055 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms