Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdrg1P59048 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdrg1P59048 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms