Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtnsP57757 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtnsP57757 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms