Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp25P57080 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp25P57080 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Usp25P57080 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms