Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtswP56203 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtswP56203 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtswP56203 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtswP56203 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms