Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp1P55194 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp1P55194 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms