Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GemP55041 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GemP55041 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GemP55041 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GemP55041 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GemP55041 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms