Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pms2P54279 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pms2P54279 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms