Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RabggtbP53612 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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